處理蒸汽發生器的垢層沉積問題，可以采取以下措施：

定期清洗：定期對蒸汽發生器進行清洗，清除水垢和沉積物，保持設備的清潔和熱效率。

化學除垢：使用化學清洗劑對蒸汽發生器進行清洗，將水垢和沉積物溶解并排出。

機械除垢：使用機械清洗設備對蒸汽發生器進行清洗，如高壓水射流清洗等，清除水垢和沉積物。

需要注意的是，不同的垢層沉積物需要采用不同的清洗方法和清洗劑，因此在進行清洗前需要了解垢層的成分和性質，選擇合適的清洗方法和清洗劑。

同時，清洗過程中需要注意安全，避免對設備和人員造成傷害。

其實最好的辦法是從源頭減少垢層沉積問題，可以配套水處理系統，提高水的品質，減少垢層的產生。